Las algas son susceptibles a cualquier cambio en sus ecosistemas acuáticos, y los contaminantes pueden suponer desequilibrar sus poblaciones. Científicos de la Universidad Autónoma de Madrid y la de A Coruña han analizado los efectos tóxicos de un compuesto antimicrobiano presente en muchos productos cosméticos de uso diario. Los resultados demuestran cómo este desinfectante afecta significativamente a las algas. Read more

julio 20, 2017 | Lic. Heidy Ramírez Vázquez | Filed under: Biología, Toxicología | Etiquetas: , |

La Unidad de Minería de Textos en Biología ha presentado en un artículo publicado en la revista Nucleic Acids Research (NAR) la herramienta online LimTox, desarrollada en el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO).

 

limtox-un-buscador-o

 El software incorpora la última tecnología en minería de textos, lenguaje  y aprendizaje automático para potenciar el motor de búsqueda biomédico. LimTox permite la recuperación y clasificación de elementos químicos y biológicos de interés, las interacciones entre ellos, la visualización de las estructuras químicas de los compuestos detectados de forma automática en los textos y la generación de redes de relación entre ellos.

La complejidad de los datos biomédicos requiere motores de búsqueda sofisticados que estén específicamente diseñados para proporcionar resultados que se ajusten a los términos de búsqueda. Además, hay un interés creciente por herramientas que se integren de forma sencilla y que sean capaces de construir bases de conocimiento biológico y de analizar datos experimentales.

«El trabajo en minería de datos asociados a genes ha avanzado considerablemente pero en el caso de los compuestos químicos, aún hay mucho por hacer», explica Martin Krallinger, jefe de la Unidad de Minería de Textos en Biología del CNIO y responsable del artículo. «LimTox supone una aportación importante en este campo«, añade.

La obtención de información biológica y química relevante que aparece tanto en la literatura científica como en los informes de las agencias regulatorias es crucial para el conocimiento científico y la toma de decisiones en áreas como la química-biología, desarrollo de fármacos, toxicología y farmacogenética.

LimTox se centra en las reacciones adversas y la toxicidad de los compuestos químicos, con especial atención en el daño hepático, incluyendo la alteración de la función hepática y la hepatocarcinogénesis. También permite el acceso sistemático a información relevante sobre otros efectos secundarios (nefrotoxicidad, cardiotoxicidad…), alteraciones de parámetros bioquímicos relacionados con la función del hígado y de enzimas clave del metabolismo de los fármacos (citocromos P450 o CYPs).

«Entre todos los posibles efectos adversos de un fármaco, la hepatotoxicidad representa uno de los más relevantes, y puede condicionar críticamente el desarrollo o la vida de un medicamento. Por ello el hígado es fundamental en los estudios de toxicología, debido a su papel central en el metabolismo, excreción y síntesis bioquímica; además, los mecanismos por los que un fármaco puede desencadenar toxicidad hepática son diversos y complicados», explica Krallinger.

La herramienta online proporciona conocimiento estructurado extraído a partir de los abstracts y artículos completos de la biblioteca biomédica PubMed, los informes de la Agencia Europea del Medicamento (EMA) y los informes de solicitud de nuevos fármacos de la Agencia Estadounidense de Alimentos y Medicamentos (FDA).

El servidor LimTox ayudará a que investigadores y clínicos encuentren de forma rápida y eficaz reacciones adversas a través de sencillas búsquedas por palabras clave o de consultas concretas sobre compuestos químicos o genes. La herramienta es gratuita y está disponible para cualquier usuario en: http://limtox.bioinfo.cnio.es/
junio 13/2017 (immedicohospitalario.es)

Investigadores de la Universidad Autónoma de Madrid y el Centro de Biología Molecular Severo Ochoa han descrito la cadena de montaje espontáneo de un virus y han detallado el papel que desempeña la flexibilidad mecánica del virus en este proceso. Los resultados favorecen el diseño de fármacos antivirales que inhiban el autoensamblaje de virus, o que degraden las propiedades mecánicas que ayudan a su supervivencia.  Read more

Investigadores de varios centros españoles proponen en un estudio un componente social no descrito hasta la fecha en virus, que cuestiona la visión clásica de que las poblaciones de virus constan de partículas que actúan independientemente durante el proceso de infección. Los científicos explican que estos agentes patógenos emplean un mecanismo de agregación para facilitar su propagación. Read more

Un estudio realizado por el grupo de investigación en muerte celular del Idibell ha desvelado la importancia del retículo endoplasmático en el proceso de muerte celular por falta de nutrientes. Los resultados han sido publicados en Molecular and Cellular Biology. Read more

mayo 10, 2017 | Lic. Heidy Ramírez Vázquez | Filed under: Biología, Bioquímica | Etiquetas: , |

Un trabajo liderado por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha descubierto un nuevo mecanismo por el que las células reprograman su metabolismo a través de la autofagia. Los datos, que aparecen en un estudio que publica The EMBO Journal, permiten conocer mejor los mecanismos de reprogramación metabólica durante procesos fisiológicos como el nacimiento de nuevas neuronas y la diferenciación de células del sistema inmune. Read more

mayo 10, 2017 | Lic. Heidy Ramírez Vázquez | Filed under: Biología, Bioquímica, Oncología | Etiquetas: , , |

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